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《中国分子心脏病学杂志》（双月刊）创刊于2001年，由卫生部主管、中国医学科学院主办，阜外心血管病医院承办，是以基础与临床相结合为特点的分子心血管病专业学术期刊。
《中国分子心脏病学杂志》自创刊以来，期刊质量不断提高，先后被中国科学技术信息研究所万方数据库、中国学术期刊全文数据库（CNKI）、重庆维普资讯数据库等收录。2006年起被万方数据库的《中国科技核心期刊数据库》收录。
中国分子心脏病学杂志栏目设置原始论著、综述、讲座、病例报告、学术动态、述评、专题笔谈
